Contrairement à ce que vous dira le jeu dans un premier temps, on ne le termine pas en battant Rayquaza ! Si il y'a bien une chose qui m'a étonnée en jouant au premier donjon mystère equipe de secours Bleu/rouge, c'est ça durée de vie extrémement longue comparée aux autres jeux de la saga.

Pour ceux qui ont réussi à terminer le Pillier Celeste et à battre Rayquaza, après ça, vous disposerez de Donjons secrets, dont la liste est ci-dessous;

Buried Relic : Terminez Stormy Sea.

Après cela, vous devriez recevoir une lettre vous informant de la découvert de ruines. Allez parler à Lombre et Shiftry.

Darknight Relic : Achetez Secretive Forest dans la zone Ami.

Desert Region :                Débloquez la zone Ami Furnace Desert.

Far-Off Sea : Achetez la zone Ami Calm Sea.

Fiery Field : Donnez Xatu Spinda's Clear Feather

Grand Sea : Achetez la zone Ami Calm Sea.

Joyous Tower : Terminez Pitfall Valley. Vous devez avoir la zone Ami Blue Sky Meadow.

Lightning Field : Terminez Fiery Field

Meteor Cave : Soyez ami avec Lugia

Mt.Faraway : Terminez Northwind Field

Northeren Range : Achetez la zone Ami Southern Island, ayez Surf, et dormez jusqu'au jour suivant.

Northwind Field : Terminez Lightning Field

Pitfall Valley :    Terminez Northern Range.

Purity Forest : Terminez Pitfall Valley. Vous devez avoir la zone Ami Blue Sky Meadow.

Silver Trench : Terminez Stormy Sea et Pitfall Valley. Soyez ami avec Articuno, Zapdos, et Moltres. Parlez à Alakazam, Allez ensuite à Birds'are ey vous aurez WhirlS.

Southern Cavern : Obtenez la zone Ami Rock Cave.

Unown Relic : Achetez les zones Amis Ancient Chamber AN et Ancient Chamber O?

 Wish Cave : Terminez Pitfall Valley et ayez la zone Ami Blue Sky Meadow. Medicham et Ekans  se montreront peut être. Parlez leur. Plus tard, seulement Ekans se montrera. 

Western Cave : Soyez ami avec Ho-Oh.